尖銳濕疣的HPV感染通過性接觸傳播，接觸部位的小創傷可促進感染，三種鱗狀上皮(皮膚、粘膜、化生的)對HPV感染都敏感。每一型HPV與特殊的臨床損害有關，且對皮膚或粘膜鱗狀上皮各有其好發部位。當含有比較大量病毒顆粒的脫落表層細胞或角蛋白 碎片進入易感上皮裂隙中時，感染就可能產生，它可因直接接觸或少見的自動接種或經污染的內褲、浴盆、浴巾、便盆感染。
病毒感染人體后，可潛伏在基底角朊細胞間，在表皮細胞層復制，HPV侵入細胞核，引起細胞迅速分裂，同時伴隨病毒顆粒的繁殖與播散，形成特征性的乳頭瘤。晚期基因表達結構多肽，即出現結構蛋白裝配顆粒，病毒主要集中在顆粒層中的細胞核內，在表皮的顆粒層出現凹空細胞增多，組織學上正常的上皮細胞也有HPV，治療后殘余的DNA常可導致疾病的復發。
組織病理改變 表皮呈乳頭瘤樣增生，棘層肥厚。表面有輕度角化亢進及角化不全。在棘細胞及顆粒層內可見空泡化細胞，細胞胞體較大，有一圓形深染的核，核周空泡化，淡染，在核膜及漿膜間有絲狀物相連，使細胞呈貓眼狀。空泡化細胞是尖銳濕疣的特征性所見，在棘細胞中、上層更為明顯。真皮淺層血管周圍中等密度浸潤，以淋巴細胞為主，還可見漿細胞浸潤。真皮乳頭部血管擴張，乳頭增寬，上延。
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