霉菌性灰指甲為灰指甲類型中的一種，表現為全甲變質、膨起、松脆，表面疣狀，凹凸不平，此型亦多由念珠菌引起。
灰指甲的致病原因包含許多方面，這里介紹的是常見的非職業因素導致的霉菌性灰指甲的病因。
一、物理性要素
合成性指甲掩蓋劑曾作為指甲油的替代物運用，此劑可致甲板呈薄片狀零落、粗糙、有嵴、指甲剝離、指甲護皮縮短，以至指甲半月縮短、輕度甲溝炎，以上變化可能是由于該劑對指甲的封固作用及重復撕傷指甲所形成的。
二、化學致敏劑及化學刺激劑
1、指甲面底層劑：在運用指甲油前先要運用此劑，以防指甲油零落。存些甲面底層劑中含有苯酚甲醛樹脂，可惹起明顯的指甲改動包括甲板變色(黃色到簡直黑色)、甲床角化過度、出血、指甲剝離(常限于指甲遠端的小片指甲)。即便運用不含甲醛的指甲面底層劑也可惹起指甲改動，包括指甲顏色改動和指甲剝離。
2、指甲油：運用指甲油惹起指甲改動極為稀有，但在過敏者中，有極少局部的患者可于近端甲皺有脫屑性皸裂。
3、用人造指甲者可于運用2～4個月后發作嚴重的甲溝炎、指甲顏色改動，甲床常增厚、枯燥，可有指甲剝離伴指甲變薄、指甲裂。這些甲板的變形可持續數月。1979年后美國制止在用人造指甲時運用丙烯酸單體和多聚體，代之以用丁基甲基丙烯酸鹽。后者其實也是致敏物質。
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